Türk Hava Kurumu Üniversitesi İşletme Fakültesi Havacılık Yönetimi Yüksek Lisans Programı, THK Üniversitesinin teklifi ve YÖK’ün onayı ile açılmış ve 2011 yılında eğitime başlamıştır. İlk olarak 2011-2012 Bahar döneminde öğrenci alan, havacılık sektörünün çeşitli dallarına ve akademiye nitelikli eleman yetiştiren programımız İngilizce ve Türkçe olmak üzere her dönem öğrenci alarak eğitim öğretime devam etmektedir. Güncel olarak yüksek lisans programımızda İngilizce ve Türkçe olarak toplamda 15 öğrenci bulunmaktadır.